L'épopée volcanique du territoire à engendré des milieux naturels divers où s'épanouie une flore qui ne l'est pas moins. Ainsi, entre 400 et 800 m sur les bordures du territoire du Parc Naturel Régional des Volcans les forêts collinéennes sont présentes, alors que la chênaie pédonculée domine à l’ouest et au sud ouest des Monts Dore et des Monts du Cantal, aux plus faibles altitudes la chênaie sessiliflore occupe les flancs Est des vallées qui, à l’aval commencent à s’ouvrir (Vallée de l’Alagnon et différentes couzes).
Entre 800 et 1450 m, s’étendent de grandes forêts montagnardes de hêtres et de sapins. La hêtraie atlantique à houx est présente sur les replats et les pentes faibles de l’ouest de l’Auvergne alors que les hêtraies sapinières aux sols bruns acides sont situées dans les zones les plus humides et les plus froides (Vallées de la Dordogne et du Falgoux).
Au dessus de 1450 m c’est le domaine des prairies à hautes herbes, des pelouses, des landes, des milieux rocheux mais également dans les creux et dépressions des tourbières de pente et d’un milieu très luxuriant et coloré à grandes herbes, nommé mégaphorbiaie.
La Ligulaire de Sibérie (Ligularia siberica), vestige de l’aire glaciaire, la Nigritelle d’Autriche (Gymnadenia austriaca), belle orchidacée arctico-alpine au parfum de vanille, le Liondent des Pyrénées (Leontodon pyrenaicus) sur les pelouses et landes ouvertes montagnardes et subalpines, le trolle d’Europe (Trollius europaeus), renonculacé appelé également boule d’or inféodée aux prairies humides, le drosera à feuilles rondes (Drosera rotundifolia) plante carnivore des tourbières, le Saxifrage de Lamotte (Saxifraga exarata subsp. lamottei ) une endémique du Massif Central liée aux milieux rocheux, l’œillet de Montpellier (Dianthus hyssopifolius) sur les versants orientaux abrités, la gentiane jaune (Gentiana lutea) localisée dans les prairies montagnardes pâturées par les bovins et le Lis martagon (Lilium martagon) magnifique liliacée qui émaille les lisières et sous bois des forêts ne sont que quelques exemples de la diversité des fleurs du Parc.